Example - Matrix Highlighing of the Volcano Dataset
Source:vignettes/example-volcano.Rmd
example-volcano.RmdVolcano!
The R built-in volcano dataset provides topographic
information on Auckland’s Maunga Whau volcano.
Usually this information would be plotted in R by treating it as a raster object.
The raw data itself is a matrix of heights(?).
head(volcano, 2)
#> [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10] [,11] [,12] [,13] [,14]
#> [1,] 100 100 101 101 101 101 101 100 100 100 101 101 102 102
#> [2,] 101 101 102 102 102 102 102 101 101 101 102 102 103 103
#> [,15] [,16] [,17] [,18] [,19] [,20] [,21] [,22] [,23] [,24] [,25] [,26]
#> [1,] 102 102 103 104 103 102 101 101 102 103 104 104
#> [2,] 103 103 104 105 104 103 102 102 103 105 106 106
#> [,27] [,28] [,29] [,30] [,31] [,32] [,33] [,34] [,35] [,36] [,37] [,38]
#> [1,] 105 107 107 107 108 108 110 110 110 110 110 110
#> [2,] 107 109 110 110 110 110 111 112 113 114 116 115
#> [,39] [,40] [,41] [,42] [,43] [,44] [,45] [,46] [,47] [,48] [,49] [,50]
#> [1,] 110 110 108 108 108 107 107 108 108 108 108 108
#> [2,] 114 112 110 110 110 109 108 109 109 109 109 108
#> [,51] [,52] [,53] [,54] [,55] [,56] [,57] [,58] [,59] [,60] [,61]
#> [1,] 107 107 107 107 106 106 105 105 104 104 103
#> [2,] 108 108 108 107 107 106 106 105 105 104 104
volcano %>%
hl_mat(colour = ggplot2::scale_color_viridis_c()) [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10] [,11] [,12] [,13] [,14] [,15] [,16] [,17] [,18] [,19] [,20] [,21] [,22] [,23] [,24] [,25] [,26] [,27] [,28] [,29] [,30] [,31] [,32] [,33] [,34] [,35] [,36] [,37] [,38] [,39] [,40] [,41] [,42] [,43] [,44] [,45] [,46] [,47] [,48] [,49] [,50] [,51] [,52] [,53] [,54] [,55] [,56] [,57] [,58] [,59] [,60] [,61] [1,] 100 100 101 101 101 101 101 100 100 100 101 101 102 102 102 102 103 104 103 102 101 101 102 103 104 104 105 107 107 107 108 108 110 110 110 110 110 110 110 110 108 108 108 107 107 108 108 108 108 108 107 107 107 107 106 106 105 105 104 104 103 [2,] 101 101 102 102 102 102 102 101 101 101 102 102 103 103 103 103 104 105 104 103 102 102 103 105 106 106 107 109 110 110 110 110 111 112 113 114 116 115 114 112 110 110 110 109 108 109 109 109 109 108 108 108 108 107 107 106 106 105 105 104 104 [3,] 102 102 103 103 103 103 103 102 102 102 103 103 104 104 104 104 105 106 105 104 104 105 106 107 108 110 111 113 114 115 114 115 116 118 119 119 121 121 120 118 116 114 112 111 110 110 110 110 109 109 109 109 108 108 107 107 106 106 105 105 104 [4,] 103 103 104 104 104 104 104 103 103 103 103 104 104 104 105 105 106 107 106 106 106 107 108 110 111 114 117 118 117 119 120 121 122 124 125 126 127 127 126 124 122 120 117 116 113 111 110 110 110 109 109 109 109 108 108 107 107 106 106 105 105 [5,] 104 104 105 105 105 105 105 104 104 103 104 104 105 105 105 106 107 108 108 108 109 110 112 114 115 118 121 122 121 123 128 131 129 130 131 131 132 132 131 130 128 126 122 119 115 114 112 110 110 110 110 110 109 109 108 107 107 107 106 106 105 [6,] 105 105 105 106 106 106 106 105 105 104 104 105 105 106 106 107 109 110 110 112 113 115 116 118 119 121 124 126 126 129 134 137 137 136 136 135 136 136 136 135 133 129 126 122 118 116 115 113 111 110 110 110 110 109 108 108 108 107 107 106 106 [7,] 105 106 106 107 107 107 107 106 106 105 105 106 106 107 108 109 111 113 114 116 118 120 121 122 123 125 127 129 130 135 140 142 142 142 141 140 140 140 140 139 137 134 129 125 121 118 116 114 112 110 110 110 111 110 109 109 108 108 107 107 106 [8,] 106 107 107 108 108 108 108 107 107 106 106 107 108 108 110 113 115 117 118 120 122 124 125 127 128 129 131 134 135 141 146 147 146 146 145 144 144 144 143 142 141 139 135 130 126 122 118 116 114 112 112 113 112 110 110 109 109 108 108 107 106 [9,] 107 108 108 109 109 109 109 108 108 107 108 108 110 111 113 116 118 120 123 125 127 129 130 132 134 135 137 139 142 146 152 152 151 151 150 149 148 148 146 145 143 142 139 135 131 127 122 119 117 115 115 115 114 112 110 110 109 109 108 107 107 [10,] 108 109 109 110 110 110 110 109 109 108 110 110 113 116 118 120 122 125 127 129 133 136 138 140 141 142 148 150 151 156 158 159 158 157 158 158 154 151 149 148 146 144 141 137 134 130 125 122 120 118 117 117 115 113 111 110 110 109 108 107 107 [11,] 109 110 110 111 111 111 111 110 110 110 112 114 118 121 123 125 127 129 133 137 141 143 145 146 148 150 154 156 159 161 162 163 164 163 164 164 160 157 154 151 149 146 144 140 137 133 129 126 124 121 119 118 116 114 112 111 110 109 108 107 106 [12,] 110 110 111 113 112 111 113 112 112 114 116 119 121 124 127 129 133 138 143 146 149 149 151 153 154 157 159 160 163 165 166 167 168 168 168 168 166 162 159 157 154 152 149 144 140 136 133 131 128 125 122 119 117 115 113 111 110 109 108 107 106 [13,] 110 111 113 115 114 113 114 114 115 117 119 121 124 126 129 133 140 145 150 154 155 155 157 159 161 162 164 165 167 168 169 170 172 174 172 172 171 169 166 163 161 158 153 148 143 140 137 134 131 128 125 120 118 116 114 112 110 109 108 107 105 [14,] 111 113 115 117 116 115 116 117 117 119 121 124 126 128 132 137 143 151 156 161 161 162 163 165 166 167 168 170 171 173 175 177 179 178 177 176 176 174 171 169 165 161 156 152 148 144 140 138 135 131 127 123 119 117 115 113 111 110 108 106 105 [15,] 114 115 117 117 117 118 119 119 120 121 124 126 128 131 137 143 150 156 160 163 165 168 170 171 172 173 174 175 177 179 180 182 183 183 183 183 180 178 177 172 168 164 160 156 152 148 144 141 138 134 130 126 121 117 114 112 110 110 108 106 104 [16,] 116 118 118 118 120 121 121 122 122 123 125 128 130 134 141 147 152 156 160 165 168 170 174 176 179 180 181 181 182 182 183 184 186 187 187 184 184 181 180 176 172 168 165 161 157 153 149 145 142 138 133 129 125 120 115 111 110 110 108 106 104 [17,] 118 120 120 121 122 123 124 124 125 126 127 129 132 135 142 149 153 157 161 166 170 174 178 180 182 183 184 184 185 186 186 187 189 189 189 189 189 186 182 179 175 171 168 165 162 157 152 149 145 141 137 131 125 120 116 111 110 110 108 106 104 [18,] 120 121 122 123 124 125 126 127 127 128 130 132 134 137 142 151 155 158 162 169 172 176 181 183 184 186 187 188 189 189 189 189 190 190 191 190 190 188 186 183 180 175 171 168 165 161 157 152 149 145 141 134 127 121 116 112 110 110 108 106 104 [19,] 120 122 125 126 126 127 128 129 130 130 132 134 136 139 145 152 157 160 167 172 175 178 181 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